MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 2

Total Repeats: 5912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017552	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	386076038
2	NC_017552	AAATC	2	10	67	76	60 %	20 %	0 %	20 %	386076038
3	NC_017552	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
4	NC_017552	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	386076038
5	NC_017552	T	7	7	224	230	0 %	100 %	0 %	0 %	386076038
6	NC_017552	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
7	NC_017552	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	386076038
8	NC_017552	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	386076038
9	NC_017552	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
10	NC_017552	CCT	2	6	611	616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076038
11	NC_017552	T	7	7	638	644	0 %	100 %	0 %	0 %	386076038
12	NC_017552	TTA	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076038
13	NC_017552	GAT	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
14	NC_017552	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076038
15	NC_017552	GAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
16	NC_017552	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	386076038
17	NC_017552	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	386076038
18	NC_017552	AGAAA	2	10	799	808	80 %	0 %	20 %	0 %	386076038
19	NC_017552	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	386076038
20	NC_017552	GGTCT	2	10	922	931	0 %	40 %	40 %	20 %	386076038
21	NC_017552	TGC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076038
22	NC_017552	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	386076038
23	NC_017552	CGGAGA	2	12	1040	1051	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386076038
24	NC_017552	AAG	2	6	1057	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
25	NC_017552	ATG	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
26	NC_017552	ACG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076038
27	NC_017552	A	6	6	1302	1307	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
28	NC_017552	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076038
29	NC_017552	ACT	2	6	1392	1397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076038
30	NC_017552	A	6	6	1424	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
31	NC_017552	GAA	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
32	NC_017552	AAG	2	6	1537	1542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
33	NC_017552	GTT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076038
34	NC_017552	GAC	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076038
35	NC_017552	TCC	3	9	1793	1801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076038
36	NC_017552	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076038
37	NC_017552	GAG	2	6	1912	1917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076038
38	NC_017552	TTC	3	9	1919	1927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
39	NC_017552	TGG	2	6	1976	1981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076038
40	NC_017552	CTT	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
41	NC_017552	A	6	6	2120	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	386076038
42	NC_017552	T	6	6	2145	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	386076038
43	NC_017552	CGG	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076038
44	NC_017552	CTT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
45	NC_017552	CGG	2	6	2434	2439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386076038
46	NC_017552	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076038
47	NC_017552	AAT	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386076038
48	NC_017552	TCC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076039
49	NC_017552	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076039
50	NC_017552	ATC	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076039
51	NC_017552	AGGAGA	2	12	2883	2894	50 %	0 %	50 %	0 %	386076039
52	NC_017552	A	6	6	2899	2904	100 %	0 %	0 %	0 %	386076039
53	NC_017552	GGT	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076039
54	NC_017552	AGA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
55	NC_017552	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	386076039
56	NC_017552	T	8	8	3086	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	386076039
57	NC_017552	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	386076039
58	NC_017552	CTT	2	6	3179	3184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076039
59	NC_017552	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	386076039
60	NC_017552	AAG	2	6	3254	3259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
61	NC_017552	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
62	NC_017552	AGA	2	6	3286	3291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076039
63	NC_017552	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	386076039
64	NC_017552	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	386076039
65	NC_017552	TTCTTT	2	12	4075	4086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386076040
66	NC_017552	GGT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076040
67	NC_017552	A	6	6	4097	4102	100 %	0 %	0 %	0 %	386076040
68	NC_017552	GTAT	2	8	4239	4246	25 %	50 %	25 %	0 %	386076040
69	NC_017552	TCT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
70	NC_017552	TTCC	2	8	4312	4319	0 %	50 %	0 %	50 %	386076040
71	NC_017552	TC	3	6	4332	4337	0 %	50 %	0 %	50 %	386076040
72	NC_017552	TGT	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076040
73	NC_017552	TTC	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
74	NC_017552	CCA	2	6	4387	4392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386076040
75	NC_017552	TTC	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
76	NC_017552	AAG	2	6	4486	4491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076040
77	NC_017552	GAACCG	2	12	4512	4523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386076040
78	NC_017552	AGA	3	9	4553	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076040
79	NC_017552	T	7	7	4593	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	386076040
80	NC_017552	T	9	9	4617	4625	0 %	100 %	0 %	0 %	386076040
81	NC_017552	T	6	6	4627	4632	0 %	100 %	0 %	0 %	386076040
82	NC_017552	GAAA	2	8	4720	4727	75 %	0 %	25 %	0 %	386076040
83	NC_017552	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076040
84	NC_017552	CGT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076040
85	NC_017552	TTC	2	6	4789	4794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076040
86	NC_017552	TGT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076040
87	NC_017552	GGT	2	6	4833	4838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076040
88	NC_017552	TCT	2	6	5329	5334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
89	NC_017552	A	6	6	5373	5378	100 %	0 %	0 %	0 %	386076041
90	NC_017552	CAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386076041
91	NC_017552	AGAA	2	8	5496	5503	75 %	0 %	25 %	0 %	386076041
92	NC_017552	TTC	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
93	NC_017552	CCT	2	6	5572	5577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076041
94	NC_017552	GAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076041
95	NC_017552	ATT	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386076041
96	NC_017552	T	6	6	5697	5702	0 %	100 %	0 %	0 %	386076041
97	NC_017552	A	6	6	5717	5722	100 %	0 %	0 %	0 %	386076041
98	NC_017552	TTTC	2	8	5737	5744	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
99	NC_017552	A	6	6	5752	5757	100 %	0 %	0 %	0 %	386076041
100	NC_017552	TC	3	6	5788	5793	0 %	50 %	0 %	50 %	386076041
101	NC_017552	ATC	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076041
102	NC_017552	TTTC	2	8	5899	5906	0 %	75 %	0 %	25 %	386076041
103	NC_017552	TGGA	2	8	5918	5925	25 %	25 %	50 %	0 %	386076041
104	NC_017552	TTC	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076041
105	NC_017552	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076041
106	NC_017552	T	6	6	6104	6109	0 %	100 %	0 %	0 %	386076041
107	NC_017552	GTTTT	2	10	6590	6599	0 %	80 %	20 %	0 %	386076042
108	NC_017552	CTC	2	6	6684	6689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076042
109	NC_017552	TC	3	6	6724	6729	0 %	50 %	0 %	50 %	386076042
110	NC_017552	GGA	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386076042
111	NC_017552	AAAT	2	8	6801	6808	75 %	25 %	0 %	0 %	386076042
112	NC_017552	CTT	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076042
113	NC_017552	TA	3	6	7027	7032	50 %	50 %	0 %	0 %	386076042
114	NC_017552	GTA	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386076042
115	NC_017552	A	7	7	7085	7091	100 %	0 %	0 %	0 %	386076042
116	NC_017552	AT	4	8	7110	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	386076042
117	NC_017552	GAA	2	6	7153	7158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076042
118	NC_017552	AG	3	6	7216	7221	50 %	0 %	50 %	0 %	386076042
119	NC_017552	GAA	2	6	7252	7257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076042
120	NC_017552	A	9	9	7340	7348	100 %	0 %	0 %	0 %	386076043
121	NC_017552	T	7	7	7372	7378	0 %	100 %	0 %	0 %	386076043
122	NC_017552	CTC	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386076043
123	NC_017552	A	8	8	7474	7481	100 %	0 %	0 %	0 %	386076043
124	NC_017552	TCAT	2	8	7492	7499	25 %	50 %	0 %	25 %	386076043
125	NC_017552	TAC	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386076043
126	NC_017552	TTC	2	6	7579	7584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
127	NC_017552	A	6	6	7590	7595	100 %	0 %	0 %	0 %	386076043
128	NC_017552	CTT	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
129	NC_017552	GAGAA	2	10	7649	7658	60 %	0 %	40 %	0 %	386076043
130	NC_017552	TTC	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
131	NC_017552	T	7	7	7720	7726	0 %	100 %	0 %	0 %	386076043
132	NC_017552	T	6	6	7833	7838	0 %	100 %	0 %	0 %	386076043
133	NC_017552	CTTT	2	8	7920	7927	0 %	75 %	0 %	25 %	386076043
134	NC_017552	TGC	2	6	7958	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386076043
135	NC_017552	GTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386076043
136	NC_017552	AGA	3	9	8039	8047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076043
137	NC_017552	GGT	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386076043
138	NC_017552	TTC	2	6	8104	8109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
139	NC_017552	CAAA	2	8	8252	8259	75 %	0 %	0 %	25 %	386076043
140	NC_017552	A	6	6	8257	8262	100 %	0 %	0 %	0 %	386076043
141	NC_017552	TTC	2	6	8276	8281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386076043
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256	NC_017552	C	6	6	13646	13651	0 %	0 %	0 %	100 %	386076048
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258	NC_017552	GA	3	6	13741	13746	50 %	0 %	50 %	0 %	386076048
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262	NC_017552	A	6	6	13977	13982	100 %	0 %	0 %	0 %	386076049
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268	NC_017552	GAA	2	6	14118	14123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386076049
269	NC_017552	A	8	8	14151	14158	100 %	0 %	0 %	0 %	386076049
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